Крупные делеции при раке

Более 150 наследственных заболеваний обусловлены делецией генов, которые могут захватывать от нескольких нуклеотидных пар до нескольких сотен тысяч. Размер делений лежит в основе их классификации. Места развития делений обычно неслучайны: некоторые последовательности ДНК более подвержены этому событию, чем другие; спонтанные делеции часто происходят в одних и тех же последовательностях разных генов. Эта неслучайность делеции особенно заметна при исследовании генетических заболеваний. Делеции происходят в случае гомологичной, но не равной рекомбинации между генами. Сходные последовательности в геноме могут перемещаться на протяжении митоза или мейоза, что может привести к укорочению гена. Наиболее часто мутации этого типа происходят в длинных гомологичных областях.

Повторяющиеся последовательности ДНК особенно подвержены делениям, т. к. их структура допускает возможность потерь. Данный механизм называется гомологичной, или неравной, рекомбинацией между повторяющимися элементами. Наиболее распространенная повторяющаяся последовательность — Alu-повтор (до 106 последовательностей Alu во всем геноме). Alu-повторы находятся на расстоянии 4 тыс. пар оснований, имеют длину 300 пар нуклеотидов и разделены короткими регионами, насыщенными аденозиновыми основаниями (А-регионы). Степень гомологии Alu-элементов достигает 70—90 %; их 3′-концы включают поли-А-хвосты и внутренний промотор РНК-полимеразы III. Alu-повторы особенно подвержены частым мутациям.